Plateformes, plateaux techniques, infrastructures et services
Plateformes, plateaux techniques, infrastructures et services
Analyses de l’ADN, génotypage, et génomique
- Plateforme Montpellier GenomiX (MGX)de l’Unité Mixte de ServiceBiocampus, qui offre des technologies de pointe dans le domaine de la génomique.Elle fait partie del’Infrastructure nationale France Génomique.
- Le Grand plateau technique régional de génotypagequi fédère et coordonne l’activité de plusieurs plateaux techniques dédiés aux activités de génotypage dans le domaine de l’Agro-Biodiversité.
- Plateforme d’ADN dégradé (ANDdeg)qui permet l’extraction d’ADN dégradé avec la rigueur scientifique indispensable à l’authentification des résultats (laboratoires pré- et post-PCR physiquement séparés ; locaux et équipement strictement dédiés aux expériences pré-PCR).Labellisée par le LabexCemeb
- Plateforme Cyto-Génomique Evolutive (CytoEvol)qui propose des outils permettant la mise en œuvre de projets de cyto-génomique ayant pour objet l’étude de l’architecture et/ou la fonction du génome, des chromosomes de la chromatine et des gènes.Labellisée par leLabex Cemeb
- Plateau d’analyse fonctionnelle et édition des génomes et d’ingénierie cellulaire (AFEG)qui a pour vocation d’offrir, aux communautés scientifiques végétalistes, l’environnement et les outils pour conduire chez les espèces méditerranéennes et tropicales les études permettant d’élucider la fonction des gènes.
- Plateau Technique de Transcriptomique (GeneAtlas)qui est un outil d’analyse transcriptomique dédié à l’étude de l’expression des gènes chez les plantes modèles.
- Plateau technique « Biologie Moléculaire »qui permet de générer des données génétiques nécessaires à la caractérisation de la biodiversité et aux études de phylogénie et de génétique des populations mais également à l’étude de la structure des génomes, de l’adaptation des organismes, et de la fonction des gènes pour des espèces ou communautés d’intérêt.
- Plateforme Génomique, Ecologie Moléculaire, Evolution Expérimentale (GEMEX)qui permet la mise au point d’outils et de techniques de biologie moléculaire, de génomique et bioinformatique, de microbiologie et leur mise à disposition.
- Plateforme Epigénomique, Environnementale (P2E)qui offre la possibilité d’effectuer des expériences de biologie moléculaire (« wet-bench ») et l’analyse des données issue d’approches de séquençage massif (« dry-bench ») dans les domaines de l’épigenétique, épigénomique et épigénétique des populations.Labellisée par leLabex Cemeb.
Analyses chimiques, biologiques, biotechnologiques, physiologiques
- Plateforme Montpellier Alliance for Metabolomics and Metabolism (MAMMA)de l’unité Mixte de Service Biocampus , qui offre un accès à des technologies analytiques de pointe pour l’étude du métabolisme.
- Pôle Protéomique de Montpellier (PPM)de l’unité Mixte de ServiceBiocampus qui utilise localement les techniques et approches les plus avancées en protéomique.
- Plateforme ECOTROPqui permet la réception, la préparation, le stockage et la manipulation de sols de pays tiers nécessitant une mesure de quarantaine (niveau L2).Labellisée par leLabex Cemeb.
- Plateau Ecophysiologiequi étudie et vise à comprendre le fonctionnement physiologique et les réponses adaptatives des plantes dans leur environnement.
- Expression Hétérologue et Electropysiologie Végétale (EHEV)qui offre des possibilités d’expression hétérologue dans différents systèmes cellulaires animaux et végétaux et caractérisation fonctionnelle de protéines membranaires, notamment par des approches d’électrophysiologie.
- Plateau Phénotypage biochimique (PPB)qui utilise des méthodologies de biochimie moyen débit pour une meilleure compréhension du fonctionnement de la plante et pour la caractérisation de sa biomasse dans un contexte d’appui à l’amélioration génétique.
- Plateau mycologiequi permet la manipulation et l’étude de champignons compatibles au niveau de confinement L1 et regroupe une collection de champignons pathogènes.
- Plateforme Polyphénols (PFP)qui permet la caractérisation et l’analyse des composés phénoliques ou des systèmes supramoléculaires les impliquant.
- Caractérisation des lipides et polymères végétaux hydrophobes pour une chimie verte et durable (PlantLipPol-Green)qui permet la caractérisation des lipides et polymères végétaux hydrophobes pour une chimie verte et durable.
- Laboratoire de technologie et de caractérisation des fibres naturelles (LTC)qui met au point des méthodes performantes de caractérisation afin d’améliorer la qualité des produits du cotonnier et leur valorisation.
- Plateau Technique d’analyse des composés volatils (PTV)qui offre un ensemble d’équipements de pointe permettant l’identification et la quantification d’un grand nombre de composés volatils.
- Atelier de quantification isotopique (AQUI)qui permet l’analyse d’isotopes stables (C, N, H, O, S) et radioactifs (H, P, S).
- Laboratoire de méthodes spectralesqui permet l’analyse de grandes séries d’échantillons de produits agroalimentaires par des méthodes telles que la Spectrométrie Proche Infrarouge (SPIR) et la Spectroscopie de Fluorescence Frontale.
- Laboratoire d’optiquequi a pour objectif le développement de capteurs pour la caractérisation des milieux qui sont aux cœurs des agrobioprocédés.Fait partie duréseau Hélio-SPIR.
- Plateau Ingénierie cellulaire (InCell)qui maîtrise différentes approches d’ingénierie cellulaire appliquées à l’amélioration d’espèces tropicales et méditerranéennes principalement en terme de réponses adaptatives aux contraintes biotiques et abiotiques.
- Plateau Technique histologie / biomécaniquedédié à la machine de tests mécaniques Instron 5200 équipée d’un extensomètre avec vidéo qui peut être utilisé sur une large gamme de paramètres, y compris la résistance en flexion et la rupture.
- Plateau de biologie moléculaire & de transcriptomiquepour des analyses fines de biologie moléculaire, du dosage et du contrôle qualité des acides nucléiques à l’étude d’expression de gènes des hôtes et/ou des pathogènes pouvant aller jusqu’au haut débit.
- Laboratoire de biologie moléculairequi permet la mise en œuvre des outils de biologie moléculaire pour la caractérisation des communautés microbiennes (bactéries et champignons) des matrices d’intérêts.
- Plateau de cytométrie en fluxqui permet la mesure simultanée de plusieurs caractéristiques physiques (taille et granularité) et moléculaires de nombreux types cellulaires (eucaryotes, bactéries, levures, parasites…), de molécules membranaires (récepteurs, protéines de surface) ou intracellulaires par la technologie de cytométrie.
- Unité de Service « Analyses des sols, eaux et végétaux ».La gestion des espaces cultivés repose sur la connaissance de la fertilité des sols et le suivi de la nutrition des plantes. Les analyses physico-chimiques sont à la base de toute tentative d’amélioration de la productivité.
- Plateforme technique de Montpellierde l’UR Recyclage et Risques, dispose d’équipements permettant de réaliser des analyses : CPG, COTmètre Shimadzu, HPIC, incubateurs, dispositifs expérimentés d’élution sur colonne, banc Wind, infiltromètre, phytotrons, salle de broyage.
- Service d’Analyses Multi-élémentaires (SAME)de l’UMR BPMP, qui analyse le contenu élémentaire d’échantillons d’origine végétale (racines, feuilles, fruits, graines, fluides cellulaires…) ainsi que d’échantillons de sols.
Imagerie
- Plateforme Montpellier Rio Imaging (MRI)de l’Unité Mixte de ServiceBiocampus, qui est la plateforme d’imagerie cellulaire de la région Montpelliéraine et qui offre un accès à une instrumentation de pointe en Microscopie optique et électronique, Cytométrie en flux et microtomographie RX.
- Notamment via :
- Plateaud’histocytologie et d’imagerie cellulaire végétale (PHIV)qui propose des techniques d’immunolocalisation en microscopie optique chez les plantes.
- Plateau de microtomographie (RX)qui utilise la microtomographie (XMT), méthode d’analyse structurale non destructive combinant un technique d’imagerie par rayons X et des algorithmes tomographiques.Labellisée par leLabex Cemeb.
- Microtomographie à rayons X (MRI-CTScan)qui permet l’étude de la structure interne d’un objet (biologique ou non biologique) de manière non destructive.
- Plateau d’imagerie in vivo,dispositif d’imagerie permettant d’étudier l’infection chez l’animal et de suivre les animaux infectés grâce à un pathogène marqué en bioluminescence. Ce système est non seulement applicable sur les petits rongeurs souris, rats, mais aussi sur des tiques et autres insectes.
Alimentation, transformations alimentaires et non alimentaires, analyse sensorielle
- Plateforme de technologie agroalimentairespécialisée dans le domaine du génie des procédés alimentaires, et qui met son expertise pluridisciplinaire à la disposition des projets de recherche en lien avec les pays du Sud et au service des centres techniques et des entreprises agroalimentaires régionales.
- Atelier de Technologie Alimentaire (ATA)de l’Université de Montpellier, qui est une Plateforme Technologique dédiée à l’enseignement, la recherche et le transfert de technologies, dans le domaine des industries agro-alimentaires et bio-industries.
- Plateau technique Fermentations(PTferm)qui regroupe des outils innovants et multi-échelles de suivi en ligne et de contrôle de la fermentation alcoolique dans le contexte œnologique.
- Halle de biotechnologiequi permet la culture de microorganismes et la production, la purification et la caractérisation de biomolécules et de protéines.
- Laboratoire de caractérisation physico-chimique des produits agroalimentairesqui analyse les caractéristiques et propriétés de base des produits alimentaires élaborées lors des transformations pilotes et qui met à disposition des équipements spécifiques à l’étude des propriétés mécaniques et rhéologiques des aliments.
- Plateforme de rhéologie et mesures physiques pour la caractérisation des matériaux alimentaires et non alimentairesqui permet de relier les propriétés rhéologiques et mécaniques intrinsèques des matériaux à leurs performances technologiques.
- Plateforme de pharmacologie des micronutrimentsqui a pour domaine de compétence la pharmacologie fonctionnelle et moléculaire des produits issus de la biodiversité alimentaire visant à caractériser les effets santé de l’aliment.
- Laboratoire d’analyse sensoriellequi propose des expertises, des prestations de service ou des appuis scientifiques en analyse sensorielle aux différents projets de recherche conduits sur les produits tropicaux d’origine végétale ou animale.
- Plateau technique d’analyse sensorielle (PTAS)qui a pour mission de mesurer et de contrôler les caractéristiques organoleptiques des vins et des jus de raisin par un jury expert sélectionné et entraîné.
- Plateforme de transformation des produits végétaux(PLANET :Processing of PLANt products with Emergent Technologies) qui traite des matières premières végétales d’origines diverses (céréales, matériaux ligno-cellulosiques) destinées à des valorisations sous forme d’aliments, d’énergie, de biomatériaux ou de biomolécules.
Intégré à l’institut Carnot 3BACR <https://3bcar.fr/> et au réseauRMT Al-Chimie.
- Plateforme Bois et Molécules du végétaldont les actions conduites sur la connaissance et la valorisation du matériau bois et de ses produits dérivés s’appuient sur des équipements et dispositifs d’essais spécifiques à chaque domaine de compétence.
- Laboratoire spécialisé dans l’alimentation animale pour les pays tropicauxqui conduit des recherches sur les ressources alimentaires et offre une prestation accessible aux acteurs des productions animales pour la connaissance de la valeur nutritive de leurs matières premières.
Vecteurs, bioagresseurs et maladies
- Réseau Montpelliérain sur les vecteurs et les maladies émergentes (Vectopôle Sud)regroupe des d’infrastructures pour innover dans la lutte contre les ravageurs de cultures et les vecteurs de pathogènes, responsables de maladies infectieuses humaines ou animales.Labellisée par leLabex Cemeb.
- Serre de Quarantaine de Canne à sucre (Visacane)qui fournit des variétés saines de canne à sucre dans le monde entier, pour l’industrie sucrière et pour les centres de création variétale.
- Plateforme de diagnostic moléculaire haut débitqui est dédiée à la détection et à la caractérisation moléculaire des pathogènes à haut-débit : fièvre catarrhale ovine, grippe aviaire, PPCB, PPA, PPR, fièvre vallée du Rift…
- Centre National de Référence des Leishmanioses (CNR-L)qui développe, dans le domaine desLeishmaniaet des leishmanioses, les différentes missions imparties aux CNR : missions d’expertise, de surveillance épidémiologique, d’alerte et de conseil des pouvoirs publics et professionnels de santé.
- Laboratoire de confinement P3qui permet de répondre aux normes internationales de biosécurité et de biosûreté.
Serres expérimentales et expérimentations, agronomiques, écologiques et végétales en milieux contrôlés
- Ecotron Européen de Montpellierqui est un dispositif expérimental en écologie pour étudier l’impact du climat sur le fonctionnement des écosystèmes et de la biodiversité.
Membre de l’Infrastructure nationale d’Analyse et Expérimentation sur les Ecosystèmes (AnaEE-France) et très grande infrastructure et une unité de service de l’Institut d’écologie et d’environnement (INEE) du CNRS.
- Plateformes de phénotypage des plantes de Montpellier(M3P :Montpellier Plant Phenotyping Plateform)qui réalise des phénotypages haut débit permettant d’analyser et de modéliser la variabilité génétique de la réponse des plantes aux stress environnementaux et aux changements climatiques (sécheresse, hautes températures notamment).Membre de l’Infrastructure nationale de phénomique végétalePHENOME-EMPHASIS.
- Réseau des Serres Expérimentales de Montpellier (RéSEM)qui a pour rôle de fédérer la communauté des utilisateurs de serres destinées à l’expérimentation et à l’enseignement, mais aussi de structurer et mutualiser une politique selon un ensemble de directions (réglementations, aspects environnementaux et énergétiques, facturation, ergonomie, métrologie, formation, veille technologique …).
- Plateau de Phénotypage du développement racinaire (PhR)qui permet d’analyser, de façon non destructive et cinétique, la croissance du système racinaire de plantules de diverses espèces (Arabidopsis, riz, tomate, colza,Medicago…) cultivées in vitro.
- Plateforme Aquacole expérimentale de l’ISEM (PLATAX)qui offre des installations permettant de réaliser des expérimentations sur des poissons, dans les domaines de la physiologie, de la nutrition, de la pathologie, de la domestication et des sciences de l’environnement (adaptation des organismes aux conditions du milieu).
- Plateforme expérimentale aquacole (PEMP)qui permet la compréhension des processus d’Adaptation et d’Adaptabilité des Animaux et des Systèmes d’élevage dans une approche multi-disciplinaire combinant la génétique, la physiologie, l’éthologie, l’écologie, la zootechnie et l’ingénierie des systèmes
Participation aux infrastructures nationales de recherche :
- Infrastructure de Recherche AnaEE-France(Analyses et Expérimentations sur les Ecosystèmes)
- Infrastructure de Recherche PHENOME–EMPHASIS(European Multi-enviroment Plant pHenomics And Simulation InfraStructure) – France
Expérimentations et observations agronomiques et/ou écologiques au champ et/ou in situ
- Unité expérimentale DIASCOPElieu d’étude et d’observation de la Diversité (des plantes et de la biodiversité en général) et de leurs capacités d’Adaptation à des environnements divers.Membre de l’Infrastructure nationale de phénomique végétalePHENOME-EMPHASIS, pour la Plateforme DiaPhen)
- Unité expérimentale sur les systèmes maraîchers agroécologiques (Alenya)dédiée à l’élaboration de systèmes agroécologiques innovants en production maraîchère sous serres et abris plastiques de pleine terre.
- Unité expérimentale de Pech Rougepour concevoir et organiser des recherches concernant la filière viticulture œnologie, tout en assurant le transfert et la valorisation des actions les plus innovantes.
- Site expérimental de Puéchabondédié à l’étude des thèmes environnementaux majeurs dont la biodiversité, les changements globaux à l’échelle de la planète et le développement durable.Membre de l’Infrastructure nationale d’Analyse et Expérimentation sur les Ecosystèmes (AnaEE-France)
- Dispositif en agroforesterie tempérée (RAP)mène des recherches principalement sur des parcelles associant des noyers hybrides (cultivés pour la production de bois) et des céréales (blé dur en rotation avec du pois protéagineux).
- Terrain d’Expérience du CEFEqui est un lieu de création et de collecte de données par la mise en place d’expérimentations in-situ en conditions naturelles ou contrôlées dans les domaines de l’écologie.Labellisée par leLabex Cemeb.
- Plateforme Programmes à Long Termequi permet de faciliter la conduite des nombreux programmes de terrain à long terme développés par les équipes du CEFE et d’aider à leur pérennisation, en mutualisant le matériel pour le travail de terrain, le stockage et la valorisation des collections.
- Plateforme expérimentale de réutilisation d’eaux usées en irrigationqui permet d’étudier la faisabilité technique et d’évaluer les impacts agronomiques, sanitaires et environnementaux d’une filière de réutilisation des eaux usées pour l’irrigation agricole, dans le but de réduire la pression de pollution sur le milieu.
- Domaines expérimentaux de l’Institut Agro Montpellier Supagroqui permettent de préciser la contribution scientifique de l’établissement aux enjeux en agriculture, alimentation, biodiversité et environnement, avec une ouverture spécifique aux problématiques méditerranéennes et tropicales.
Participation aux infrastructures nationales de recherche :
- Infrastructure de Recherche AnaEE-France(Analyses et Expérimentations sur les Ecosystèmes)
- Infrastructure de Recherche PHENOME–EMPHASIS(European Multi-enviroment Plant pHenomics And Simulation InfraStructure) – France
Terre, eau et environnement : mesure, expérimentation et observation
- Observatoire de Recherche Méditerranéen de l’Environnement (OSU OREME), qui est un observatoire du risque et du changement global et anthropique les pieds dans la Méditerranée. Il fait partie des Observatoires des Sciences de l’Univers de l’Institut National des Sciences de l’Univers (INSU) du Cnrs.
- Equipex GEOinformation for SUstainable Development (GEOSUD)qui est un Centre national de télédétection et d’information spatiale pour le développement durable.
- Equipex RESIF-CORE (Réseau sismologique et géodésique français)qui est un nouveau système d’instrumentation pour l’observation des déformations terrestres lentes par la mise en place d’un réseau de capteurs.
- Infrastructure de Recherche Data Terra (IR Data Terra), qui est un pôle de données et de services pour le système Terre, permettant d’observer, comprendre et prévoir de manière intégrée l’histoire, le fonctionnement et l’évolution du système Terre soumis aux changements globaux.
- Plate-forme Régionale EcoTech, qui a pour but de stimuler l’innovation dans le domaine des éco-technologies pour l’agriculture, l’agro-alimentaire, les énergies renouvelables, le traitement de l’eau et des déchets.
- Plateaux Techniques de Geosciences Montpellier.La recherche à Géosciences Montpellier s’articule autour de 4 plateaux techniques et analytiques : Géochimie, Géophysique, Pétrophysique et Littoral.
Fait partie du Réseau Géochimique et Expérimental Français de l’INSU (RéGEF) et de l’Infrastructure de Recherche LIttorale et COtière (ILICO)
- Plateforme « Laboratoire Mutualisé d’Analyse des isotopes stables de l’eau (LAMA) », qui développe des projets concernant la climatologie et la paléoclimatologie, ainsi que les thématiques sur le traçage des flux surface-souterrain et des aquifères.
- Laboratoire de chimie des eaux,pour la détermination des éléments majeurs et en trace dans les eaux, mais aussi dans les sédiments et certains matériaux biologiques.
- Laboratoire d’analyse des contaminants organiques émergents,pour analyser les micropolluants organiques issus de l’activité humaine (urbaine, industrielle, agricole) dans l’eau, les sédiments et les organismes.
- Laboratoire de microbiologie,qui concerne les interactions entre micro-organismes et métalloïdes dans des environnements pollués et à l’étude des populations et communautés microbiennes et de leur dynamique dans des écosystèmes aquatiques, vulnérables et technologiques.
- Laboratoire micro polluants,dédié à l’analyse et au traçage de molécules marquées dans les colonnes de sol.
- Laboratoire de physique du sol,pour déterminer la caractéristique de rétention en eau des sols.
- Laboratoire de de stabilité structurale,consiste à évaluer la sensibilité des sols à la battance et à l’érosion.
Participation aux infrastructures nationales de recherche :
- Très Grande Infrastructure de Recherche FOF(Flotte Océanographique Française)
- Très Grande Infrastructure de Recherche ECORD-IODP(Programme international de forage profond en mer)
- Très Grande Infrastructure de Recherche ICOS(Système Intégré d’Observation du Carbone-Integrated Carbon Observation System)
- Infrastructure de Recherche ILICO(Infrastructure LIttorale et COtière)
- Infrastructure de Recherche OZCAR(Observatoire de la Zone Critique, Applications, Recherche)
- Infrastructure de Recherche RESIF(Réseau sismologique et géodésique français)
Infrastructures numériques, outils en ligne, plateformes collaboratives, modélisation
- Equipex GEOinformation for SUstainable Development (GEOSUD)et ses équipements, outils et méthodes en traitement d’image, analyse spatiale, systèmes d’information pour le développement durable.
- Plateforme logicielle de modélisation des plantes (OpenAlea)une plateforme logicielle ouverte pour la modélisation des plantes à différentes échelles.
- Pl@ntNetune plateforme participative pour l’identification des plantes et la biodiversité végétale.
- Boost AEune plateforme collaborative de partage de connaissances et de mise en réseau des acteurs de l’agroécologie à travers le monde (régions tropicales et méditerranéennes).
- Montpellier Bioinformatics Biodiversity platform (MBB)qui propose l’hébergement de logiciels, l’assistance au développement logiciel, l’accès au cluster de calcul, aux machines « big data » pour données de génomique haut débit notamment, à des pipelines d’analyse bioinformatique, et au serveur RStudio.Labellisée par le Labex Cemeb
- Plateforme South Green de bioinformatiqueune plateforme Bioinformatique dédiée à la bioinformatique appliquée à la génétique et à la génomique des plantes tropicales et méditerranéennes d’intérêt agronomique.
- Plateforme companion modelling approach (ComMod)une plateforme collaborative pour l’utilisation de la modélisation comme outil d’accompagnement dans le domaine de la gestion des ressources renouvelables.
- Service mutualisé GEOMATICun service mutualisé pour les traitements spatialisés des données.
- Plateforme de modélisation Software environment for modelling Fluxes In Landscapes (OpenFLUID)une plateforme logicielle de simulation de flux dans le paysage.
- Plateforme Mimosaune plateforme intégrée de modélisation et de simulation multi-paradigme.
- Plateforme Cormasune plateforme de modélisation et de simulation multi-agent spécialisée pour la gestion des ressources renouvelables.
- Ocelet Modelling Plateformdes outils de modélisations dédiées à la simulation de dynamiques spatiales.
- Plateforme logicielle Computer-Aided Projection of Strategies in Silviculture (CAPSIS)une plateforme informatique pour la gestion et la durabilité écologique des milieux forestiers.
- Ecoscopequi a pour but de contribuer à mieux organiser la collecte, la gestion et la valorisation des données à travers l’accès distant à différents types d’observations pour la recherche sur la biodiversité et l’expertise nécessaire aux décideurs politiques.
- Platform for Automated extraction of Disease Information from the web (PADI-Web)un outil de surveillance automatique d’articles publiés sur le web et relatifs à des événements en santé animale.
- Plateau technique « Calcul scientifique et gestion des données » (CALCUL)regroupe les moyens de calcul en bio-analyse et en bio-informatique (cluster de calcul), mais aussi les moyens de stockage et de gestion des données.
Participation aux infrastructures nationales de recherche :
- Pôle National de Données de Biodiversité (PNDB)https://www.cesgo.org/pndb/
- Pôle d’observation intégrée du système Terre (DATA TERRA)https://www.data-terra.org/
Collections et ressources génétiques
- Un bilan de l’existant est accessible dans le dossier thématique téléchargeable à l’adresse suivante :https://www.agropolis.fr/publications/collections-dossier-thematique-agropolis-international.php
Participation aux infrastructures nationales de recherche :